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Les protéobactéries (Proteobacteria) sont un groupe très important de bactéries. Ce groupe inclut des bactéries pathogènes, telles Escherichia, Salmonella, Vibrio, Helicobacter. D'autres encore sont responsables dans la fixation biologique de l'azote.
Leur nom vient du dieu grec Protée, une divinité marine qui avait la capacité de pouvoir se métamorphoser. Cela est dû à la grande variété de formes au sein de ce groupe.
Les protéobactéries sont à Gram négatif, c’est-à-dire qu'elles possèdent une membrane externe composée de lipopolysaccharides (LPS) mais pauvre en peptidoglycane. La plupart sont mobiles grâce à un flagelle, mais d'autres peuvent être immobiles ou se déplacent par glissement. Ces derniers sont les Myxobacteria, un groupe unique de bactéries capables de s'agréger formant des corps fructifiants multicellulaires ; elles présentent aussi une grande variété de métabolismes. La plupart sont anaérobies et hétérotrophes, mais les exceptions sont nombreuses. Certaines protéobactéries, les bactéries pourpres, sont autotrophes photosynthétiques.
Subdivisions
L'analyse de la séquence du gène codant l'Acide ribonucléique ribosomique 16S permet de diviser les protéobactéries en 5 catégories, allant de α à ε. (6 en 2007 avec ζ)
Rhodobacteria
Alpha Proteobacteria
- Caulobacterales — par exemple Caulobacter
- Parvularculales
- Rhizobiales — par exemple Rhizobia
- Rhodobacterales
- Rhodospirillales — par exemple Acetobacter
- Rickettsiales — par exemple Rickettsia
- Sphingomonadales — par exemple Sphingomonas
Chromatibacteria
Beta Proteobacteria
- Burkholdériales — par exemple Bordetella
- Hydrogenophilales
- Methylophilales
- Neisseriales — par exemple Neisseria
- Nitrosomonadales
- Rhodocyclales
- Procabacteriales
Gamma Proteobacteria
- Acidithiobacillales
- Aeromonadales — par exemple Aeromonas
- Alteromonadales — par exemple Pseudoalteromonas
- Cardiobactériales
- Chromatiales — bactéries poupres
- Enterobactériales — par exemple Escherichia
- Legionellales — par exemple Legionella
- Methylococcales
- Oceanospirillales
- Pasteurellales — par exemple Haemophilus
- Pseudomonadales — par exemple Pseudomonas
- Thiotrichales — par exemple Thiomargarita
- Vibrionales — par exemple Vibrio
- Xanthomonadales — par exemple Stenotrophomonas
Delta Proteobacteria
- Bdellovibrionales — par exemple Bdellovibrio
- Desulfobacterales
- Desulfovibrionales
- Desulfurellales
- Desulfuromonadales — par exemple Geobacter
- Myxococcales — Myxobactéries
- Syntrophobacterales
Epsilon Proteobacteria
- Campylobacterales — par exemple Helicobacter ou Campylobacter jejuni
- Nautiliales
Zeta Proteobacteria
- Mariprofundales
Phylogénie
- Deltaproteobacteria
- NN
- Epsilonproteobacteria
- NN
- Zetaproteobacteria
- NN
- Alphaproteobacteria
- NN
- Betaproteobacteria
- Gammaproteobacteria
Références
David Emerson, Jeremy A. Rentz, Timothy G. Lilburn, Richard E. Davis, Henry Aldrich, Clara Chan & Craig L. Moyer, 2007 : A Novel Lineage of Proteobacteria Involved in Formation of Marine Fe-Oxidizing Microbial Mat Communities. PLoS ONE 2(8). Texte original
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