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Des scientifiques produisent un puissant pigment à l'origine du camouflage des pieuvres. Crédit : Charlotte Seid

Des scientifiques produisent un puissant pigment à l’origine du camouflage des pieuvres

par La rédaction
7 novembre 2025
en Recherche, Technologie

Brittany Hook

Les scientifiques américains ont fait un pas de plus vers la découverte d’un super-pouvoir détenu par certains des plus grands « maîtres du camouflage » de la nature. Les pieuvres, les calmars, les seiches et autres animaux de la famille des céphalopodes sont bien connus pour leur capacité à se camoufler, en changeant la couleur de leur peau pour se fondre dans leur environnement. Cette remarquable capacité de mimétisme est rendue possible par des processus biologiques complexes impliquant la xanthomatrine, un pigment naturel.

En raison de ses capacités à changer de couleur, la xanthommatine intrigue depuis longtemps les scientifiques et même les militaires, mais elle s’est avérée difficile à produire et à étudier en laboratoire, jusqu’à présent.

Dans une nouvelle étude, une équipe dirigée par l’Institut océanographique Scripps de l’Université de Californie à San Diego décrit une avancée majeure dans la compréhension de la capacité de camouflage de la nature, puisqu’elle a réussi à mettre au point une nouvelle méthode pour produire de grandes quantités de pigment xanthommatine.

Leur méthode inspirée de la nature a permis pour la première fois de produire en grande quantité le matériau pigmenté dans une bactérie, ouvrant ainsi de nouvelles possibilités d’utilisation du pigment dans une large gamme de matériaux et de cosmétiques, des dispositifs photoélectroniques et revêtements thermiques aux colorants et protecteurs UV. La nouvelle approche permet de produire jusqu’à 1 000 fois plus de matériau que les méthodes traditionnelles.

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« Nous avons mis au point une nouvelle technique qui a accéléré notre capacité à produire un matériau, en l’occurrence la xanthommatine, dans une bactérie pour la première fois », a déclaré Bradley Moore, auteur principal de l’étude et chimiste marin nommé conjointement à la Scripps Oceanography et à l’École Skaggs de pharmacie et des sciences pharmaceutiques de l’université de Californie à San Diego. « Ce pigment naturel est ce qui donne à une pieuvre ou à un calmar sa capacité de camouflage, un super-pouvoir fantastique, et notre réussite dans l’amélioration de la production de ce matériau n’est que la partie émergée de l’iceberg. »

Les auteurs de l’étude ont déclaré que leur découverte était importante, non seulement pour comprendre ce pigment unique, qui éclaire la biologie et la chimie du règne animal, mais aussi parce que la technique qu’ils ont utilisée pourrait être appliquée à de nombreux autres produits chimiques, aidant potentiellement les industries à s’éloigner des matériaux à base de combustibles fossiles au profit d’alternatives naturelles.

Un pigment prometteur

Au-delà des céphalopodes, la xanthommatine est également présente chez les insectes du groupe des arthropodes, contribuant aux teintes orange et jaune vives des ailes du papillon monarque et aux rouges éclatants que l’on observe sur le corps des libellules et les yeux des mouches.

Malgré les fantastiques propriétés chromatiques de la xanthommatine, celle-ci est mal comprise en raison d’un problème d’approvisionnement persistant. La récolte du pigment chez les animaux n’est ni évolutive ni efficace, et les méthodes traditionnelles de laboratoire sont laborieuses et reposent sur une synthèse chimique à faible rendement.

Les chercheurs du laboratoire Moore de Scripps Oceanography ont cherché à changer cela en collaborant avec des collègues de l’université de Californie à San Diego et du Centre pour la biosoutenabilité de la Fondation Novo Nordisk au Danemark afin de concevoir une solution, une sorte de boucle de rétroaction de croissance qu’ils appellent « biosynthèse couplée à la croissance ».

La manière dont ils ont bio-conçu le pigment de poulpe, un produit chimique, dans une bactérie représente une nouvelle approche qui s’écarte des méthodes biotechnologiques classiques. Leur approche a étroitement lié la production du pigment à la survie de la bactérie qui le fabriquait.

« Nous avions besoin d’une approche totalement nouvelle pour résoudre ce problème », explique Leah Bushin, auteure principale de l’étude, aujourd’hui membre du corps enseignant de l’université de Stanford et anciennement chercheuse postdoctorale au Moore Lab de Scripps Oceanography, où elle a mené ses travaux. « En substance, nous avons trouvé un moyen de tromper la bactérie pour qu’elle produise davantage de la substance dont nous avions besoin. »

En général, lorsque les chercheurs tentent d’amener un microbe à produire un composé étranger, cela crée une charge métabolique importante. Sans manipulation génétique significative, le microbe résiste à détourner ses ressources essentielles pour produire quelque chose qui lui est inconnu.

En liant la survie de la cellule à la production du composé cible, l’équipe a réussi à inciter le microbe à créer de la xanthommatine. Pour ce faire, ils ont commencé par une cellule « malade » génétiquement modifiée, qui ne pouvait survivre que si elle produisait à la fois le pigment souhaité et un deuxième produit chimique appelé acide formique. Pour chaque molécule de pigment générée, la cellule produisait également une molécule d’acide formique. L’acide formique, à son tour, fournit le carburant nécessaire à la croissance de la cellule, créant ainsi une boucle autonome qui stimule la production de pigment.

« Nous avons fait en sorte que l’activité de cette voie, qui consiste à fabriquer le composé d’intérêt, soit absolument essentielle à la vie. Si l’organisme ne produit pas de xanthommatine, il ne se développe pas », ajoute M. Bushin.

Les céphalopodes comme ce calmar des récifs du sud peuvent changer la couleur de leur peau en un instant grâce à la xanthommatine, un pigment naturel.
Les céphalopodes comme ce calmar des récifs du sud peuvent changer la couleur de leur peau en un instant grâce à la xanthommatine, un pigment naturel. Photo : Luca Davenport-Thomas

Prochaines étapes

Moore prévoit que cette nouvelle méthodologie biotechnologique, entièrement inspirée de la nature et non invasive, transformera la manière dont les produits biochimiques sont fabriqués.

« Nous avons véritablement bouleversé la manière dont les gens envisagent la conception d’une cellule », a-t-il ajouté. « Notre approche technologique innovante a permis une avancée considérable en termes de capacité de production. Cette nouvelle méthode résout un problème d’approvisionnement et pourrait désormais rendre ce biomatériau beaucoup plus largement disponible. »

Bien que certaines applications de ce matériau soient encore lointaines, les auteurs ont noté un intérêt actif de la part du ministère américain de la Défense et des entreprises cosmétiques. Selon les chercheurs, les collaborateurs souhaitent explorer les capacités de camouflage naturel du matériau, tandis que les entreprises de soins de la peau souhaitent l’utiliser dans des écrans solaires naturels. D’autres industries voient des utilisations potentielles allant des peintures domestiques qui changent de couleur aux capteurs environnementaux.

« À l’avenir, les humains devront repenser la façon dont nous fabriquons les matériaux afin de soutenir notre mode de vie synthétique à 8 milliards d’individus sur Terre », a conclu M. Moore. « Grâce au financement fédéral, nous avons ouvert une nouvelle voie prometteuse pour la conception de matériaux inspirés de la nature qui sont meilleurs pour les humains et la planète. »

Les autres auteurs de l’étude sont Tobias Alter, María Alván-Vargas, Daniel Volke, Òscar Puiggené et Pablo Nikel du Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability ; Elina Olson du département de bio-ingénierie Shu Chien-Gene Lay de l’université de Californie à San Diego ; Lara Dürr et Mariah Avila du Scripps Institution of Oceanography de l’université de Californie à San Diego ; et Taehwan Kim et Leila Deravi de la Northeastern University.

Publiée le 3 novembre dans Nature Biotechnology, l’étude a été financée par les National Institutes of Health, l’Office of Naval Research, le Fonds national suisse de la recherche scientifique et la Fondation Novo Nordisk.

Source : UC San Diego

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Tags: camouflagepieuvrepigmentxanthomatrine
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Scientists at UC San Diego have moved one step closer to unlocking a superpower held by some of nature’s greatest “masters of disguise.” 

Octopuses, squids, cuttlefish and other animals in the cephalopod family are well known for their ability to camouflage, changing the color of their skin to blend in with the environment. This remarkable display of mimicry is made possible by complex biological processes involving xanthommatin, a natural pigment. 

Because of its color-shifting capabilities, xanthommatin has long intrigued scientists and even the military, but has proven difficult to produce and research in the lab — until now.

In a new study, a team led by UC San Diego’s Scripps Institution of Oceanography describes a major breakthrough in understanding nature's ability to camouflage, as they successfully developed a new way to produce large amounts of xanthommatin pigment. 

Their nature-inspired method massively over-produced the pigmented material for the first time in a bacterium, opening new possibilities for the pigment’s use in a wide range of materials and cosmetics — from photoelectronic devices and thermal coatings to dyes and UV protectants. The new approach produces up to 1,000 times more material than traditional methods.  

“We've developed a new technique that has sped up our capabilities to make a material, in this case xanthommatin, in a bacterium for the first time,” said Bradley Moore, the study’s senior author and a marine chemist with joint appointments at Scripps Oceanography and UC San Diego Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences. “This natural pigment is what gives an octopus or a squid its ability to camouflage — a fantastic superpower — and our achievement to advance production of this material is just the tip of the iceberg.” 

Published Nov. 3 in Nature Biotechnology, the study was funded by the National Institutes of Health, the Office of Naval Research, the Swiss National Science Foundation and the Novo Nordisk Foundation.

The study authors said their discovery is significant, not just for understanding this unique pigment — which sheds light into the biology and chemistry of the animal kingdom — but also because the technique they used could be applied to many other chemicals, potentially helping industries move away from fossil fuel-based materials toward nature-based alternatives. 

A promising pigment

Beyond cephalopods, xanthommatin is also found in insects within the arthropod group, contributing to the brilliant orange and yellow hues of monarch butterfly wings and the bright reds seen in dragonfly bodies and fly eyes.

Despite xanthommatin’s fantastic color properties, it is poorly understood due to a persistent supply challenge. Harvesting the pigment from animals isn’t scalable or efficient, and traditional lab methods are labor intensive, reliant on chemical synthesis that is low yielding. 

Researchers in the Moore Lab at Scripps Oceanography sought to change that, working with colleagues across UC San Diego and at the Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability in Denmark to design a solution, a sort of growth feedback loop they call “growth coupled biosynthesis.”

The way in which they bioengineered the octopus pigment, a chemical, in a bacterium represents a novel departure from typical biotechnological approaches. Their approach intimately connected the production of the pigment with the survival of the bacterium that made it. 

“We needed a whole new approach to address this problem,” said Leah Bushin, lead author of the study, now a faculty member at Stanford University and formerly a postdoctoral researcher in the Moore Lab at Scripps Oceanography, where her work was conducted. “Essentially, we came up with a way to trick the bacteria into making more of the material that we needed.”

Typically, when researchers try to get a microbe to produce a foreign compound, it creates a major metabolic burden. Without significant genetic manipulation, the microbe resists diverting its essential resources to produce something unfamiliar. 

By linking the cell’s survival to the production of their target compound, the team was able to trick the microbe into creating xanthommatin. To do this, they started with a genetically engineered “sick” cell, one that could only survive if it produced both the desired pigment, along with a second chemical called formic acid. For every molecule of pigment generated, the cell also produced one molecule of formic acid. The formic acid, in turn, provides fuel for the cell’s growth, creating a self-sustaining loop that drives pigment production.

“We made it such that activity through this pathway, of making the compound of interest, is absolutely essential for life. If the organism doesn't make xanthommatin, it won't grow,” said Bushin.

To further enhance the cells’ ability to produce the pigment, the team used robots to evolve and optimize the engineered microbes through two high-throughput adaptive laboratory evolution campaigns, which were developed by the lab of study co-author Adam Feist, professor in the Shu Chien-Gene Lay Department of Bioengineering at the UC San Diego Jacobs School of Engineering and senior scientist at the Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability. The team also applied custom bioinformatics tools from the Feist Lab to identify key genetic mutations that boosted efficiency and enabled the bacteria to make the pigment directly from a single nutrient source.

“This project gives a glimpse into a future where biology enables the sustainable production of valuable compounds and materials through advanced automation, data integration and computationally driven design,” said Feist. “Here, we show how we can accelerate innovation in biomanufacturing by bringing together engineers, biologists and chemists using some of the most advanced strain-engineering techniques to develop and optimize a novel product in a relatively short time.”

Traditional approaches yield around five milligrams of pigment per liter “if you're lucky,” said Bushin, while the new method yields between one to three grams per liter.

Getting from the planning stages to the actual experimentation in the lab took several years of dedicated work, but once the plan was put into motion, the results were almost immediate.

“It was one of my best days in the lab,” Bushin recalled of the first successful experiment. “I’d set up the experiment and left it overnight. When I came in the next morning and realized it worked and it was producing a lot of pigment, I was thrilled. Moments like that are why I do science.”

Next steps

Moore anticipates that this new biotech methodology, which is fully nature-inspired and non-invasive, will transform the way in which biochemicals are produced. 

“We've really disrupted the way that people think about how you engineer a cell,” he said. “Our innovative technological approach sparked a huge leap in production capability. This new method solves a supply challenge and could now make this biomaterial much more broadly available.”

While some applications for this material are far-out, the authors noted active interest from the U.S. Department of Defense and cosmetics companies. According to the researchers, collaborators are interested in exploring the material’s natural camouflage capabilities, while skincare companies are interested in using it in natural sunscreens. Other industries see potential uses ranging from color-changing household paints to environmental sensors.

“As we look to the future, humans will want to rethink how we make materials to support our synthetic lifestyle of 8 billion people on Earth,” said Moore. “Thanks to federal funding, we've unlocked a promising new pathway for designing nature-inspired materials that are better for people and the planet."

Additional study authors are Tobias Alter, María Alván-Vargas, Daniel Volke, Òscar Puiggené and Pablo Nikel from the Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability; Elina Olson from UC San Diego’s Shu Chien-Gene Lay Department of Bioengineering; Lara Dürr and Mariah Avila from Scripps Institution of Oceanography at UC San Diego; and Taehwan Kim and Leila Deravi from Northeastern University.

Journal

Nature Biotechnology

DOI

10.1038/s41587-025-02867-7

Method of Research

Experimental study

Subject of Research

Animals

Article Title

Growth-coupled microbial biosynthesis of the animal pigment xanthommatin

Article Publication Date

3-Nov-2025

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