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Electron microscope image of algae pre-treated with espresso to create stronger contrasts.

Image au microscope électronique d'algues prétraitées à l'espresso afin d'obtenir des contrastes plus marqués. (Crédit : Claudia Mayrhofer - FELMI-ZFE)

Le café comme substitut d’agent de coloration en microscopie électronique

par La rédaction
18 janvier 2026
en Environnement, Santé

Pour que les structures tissulaires des échantillons biologiques soient facilement reconnaissables au microscope électronique, ils sont traités avec un agent de coloration. L’agent de coloration standard pour cela est l’acétate d’uranyle. Cependant, certains laboratoires ne sont pas autorisés à utiliser cette substance hautement toxique et radioactive pour des raisons de sécurité.

Une équipe de recherche de l’Institut de microscopie électronique et de nanoanalyse (FELMI-ZFE) de l’Université de technologie de Graz (TU Graz) a maintenant trouvé une alternative écologique : l’espresso ordinaire. Les images des échantillons traités avec celui-ci étaient d’aussi bonne qualité que les images des échantillons comparatifs, qui ont été préparés avec de l’acétate d’uranyle. Les chercheurs ont publié leurs résultats dans la revue Méthodes.

Les taches de café comme inspiration

« J’ai eu l’idée d’utiliser l’espresso comme agent de coloration en voyant les taches circulaires séchées dans les tasses de café usagées », explique Claudia Mayrhofer, responsable de l’ultramicrotomie à l’institut. Pendant la préparation, elle découpe les échantillons de tissu en tranches ultra-minces et les fixe sur des porte-échantillons. La coloration est la dernière étape avant l’examen au microscope électronique. « Les tests initiaux ont montré que le café colore les échantillons biologiques et améliore les contrastes », souligne Mayrhofer.

Avec la chef d’équipe Ilse Letofsky-Papst et l’étudiant diplômé Robert Zandonella, Claudia Mayrhofer a étudié la performance de l’espresso en comparaison directe avec l’acétate d’uranyle. Dans des conditions identiques, ils ont traité des coupes ultra-minces de mitochondries avec divers agents de coloration et ont évalué la qualité des images au microscope à l’aide d’un logiciel d’analyse d’image spécial. « L’espresso a fourni des valeurs de contraste comparativement très bonnes, dans certains cas elles étaient même meilleures qu’avec l’acétate d’uranyle », explique Claudia Mayrhofer.

Des tests supplémentaires sur différents types de tissus nécessaires

Ilse Letofsky-Papst conclut : « Nos résultats montrent que le café est une alternative sérieuse à l’acétate d’uranyle. Cependant, des investigations supplémentaires sur différents types de tissus sont encore nécessaires pour permettre une application large en microscopie électronique pour les sciences de la vie. »

Retrouvez facilement Enerzine dans les actualités Google. G Ajouter Enerzine

Article : Coffee – a ubiquitous substitute for uranyl acetate in staining of biological ultrathin sections for electron microscopy studies – Journal : Methods – Méthode : Experimental study – DOI : Lien vers l’étude

Source: GRAZ UT

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Tags: cafecolorationelectroniqueespresso
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To ensure that the tissue structures of biological samples are easily recognisable under the electron microscope, they are treated with a staining agent. The standard staining agent for this is uranyl acetate. However, some laboratories are not allowed to use this highly toxic and radioactive substance for safety reasons. A research team at the Institute of Electron Microscopy and Nanoanalysis (FELMI-ZFE) at Graz University of Technology (TU Graz) has now found an environmentally friendly alternative: ordinary espresso. Images of the samples treated with it were of equally good quality as images of comparative samples, which were prepared with uranyl acetate. The researchers have published their findings in the journal Methods.

Coffee stains as inspiration

“I got the idea of using espresso as a staining agent from the circular dried stains in used coffee cups,” says Claudia Mayrhofer, who is responsible for ultramicrotomy at the institute. During preparation, she cuts tissue samples into wafer-thin slices and fixes them onto sample holders. Staining is the last step before examination under the electron microscope. “Initial tests have shown that coffee stains biological samples and enhances contrasts,” says Mayrhofer.

Together with team leader Ilse Letofsky-Papst and graduate student Robert Zandonella, Claudia Mayrhofer investigated how well espresso performs in direct comparison with uranyl acetate. Under identical conditions, they treated ultra-thin sections of mitochondria with various staining agents and assessed the quality of the microscope images using special image analysis software. “Espresso provided comparatively very good contrast values, in some cases they were even better than with uranyl acetate,” explains Claudia Mayrhofer.

Further tests with different tissue types required

Ilse Letofsky-Papst concludes: “Our results show that coffee is a serious alternative to uranyl acetate. However, further investigations on different types of tissues are still required to enable a broad application in life science electron microscopy.”

Journal

Methods

DOI

10.1016/j.ymeth.2025.08.009

Method of Research

Experimental study

Subject of Research

Cells

Article Title

Coffee – a ubiquitous substitute for uranyl acetate in staining of biological ultrathin sections for electron microscopy studies

Article Publication Date

1-Nov-2025

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