Une étude menée par des chercheurs du Département de Microbiologie de l’Université de Malaga a révélé comment l’agriculture biologique – celle qui utilise des substances et des processus naturels, évitant l’usage de produits chimiques de synthèse – peut, à long terme, aider les cultures à devenir plus résistantes à la sécheresse de manière naturelle.
Cette équipe de recherche, qui appartient également à l’Institut d’Horticulture Subtropicale et Méditerranéenne « La Mayora » (IHSM), a démontré que ce système de gestion agricole durable enrichit des groupes spécifiques de micro-organismes du sol, en particulier les bactéries, aidant ainsi les plantes à faire face au changement climatique.
Plus précisément, ces recherches confirment que les sols traités de manière biologique pendant des décennies favorisent l’augmentation des bactéries, en particulier du genre Bacillus, qui se caractérisent par une grande résilience pour survivre dans des conditions extrêmes et agissent comme un « bouclier protecteur » des plantes. Les résultats de ces recherches ont été publiés dans la revue « npj Biofilms et microbiomes», du groupe Nature.
Alliés invisibles des plantes
Pour le développement de cette étude, deux vergers d’avocatiers ont été comparés : l’un géré de manière biologique, sans produits chimiques et avec de la matière organique, et l’autre de manière conventionnelle, utilisant des engrais et une gestion intensive, tous deux situés dans la région de l’Axarquía à Malaga.
« En comparant la rhizosphère (le sol attaché aux racines des plantes) de cultures sous gestion biologique et conventionnelle pendant plus de 20 ans, nous avons identifié d’importantes différences dans leurs propriétés physico-chimiques qui jouent un rôle clé dans la composition des communautés microbiennes, observant une abondance de bactéries du genre Bacillus », explique la chercheuse et première auteure de cet article, Blanca Ruiz Muñoz.
Dans une seconde phase, en laboratoire, les chercheurs ont isolé des bactéries du genre Bacillus et évalué leur effet sur les plantes. Par différents essais, ils ont observé que certains de ces micro-organismes améliorent l’état physiologique et la croissance des plantes dans des conditions de sécheresse. « Il ne s’agit donc pas seulement de savoir que ces bactéries sont mieux préparées à survivre dans des conditions stressantes comme la pénurie d’eau, mais aussi qu’elles jouent un rôle direct dans la survie des plantes », affirment-ils.
Vers une nouvelle forme d’agriculture
Selon ces experts, ces découvertes sont particulièrement pertinentes dans le sud de l’Espagne, avec des zones très sèches, où des cultures plus résilientes signifieraient moins de pertes ; de plus, elles apporteraient également d’autres avantages importants tels que la réduction de l’utilisation d’engrais et de produits chimiques, en faveur de « bioinoculants », des produits formulés avec des micro-organismes bénéfiques pour le sol.
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« Il ne s’agit pas seulement de cultiver des plantes, mais aussi de gérer et de « former » les micro-organismes du sol pour évoluer vers une autre forme d’agriculture », conclut le professeur José A. Gutiérrez Barranquero, un autre des auteurs de cet article.
En bref, la façon dont les cultures sont cultivées aujourd’hui pourrait renforcer la capacité des cultures futures à résister au changement climatique, de sorte que la clé pour survivre à la sécheresse pourrait se trouver sous terre.
Article : Long-term organic farming shapes the avocado rhizosphere microbiota through the enrichment of drought-tolerant Bacillus spp. – Journal : npj Biofilms and Microbiomes – Méthode : Experimental study
Ruiz-Muñoz, B., Bretscher, K.M., Carrión, V.J. Cazorla, F.M., Gutiérrez-Barranquero, J.A. L’agriculture biologique à long terme façonne le microbiome de la rhizosphère de l’avocat par l’enrichissement en Bacillus spp. tolérants à la sécheresse. npj Biofilms Microbiomes (2026). https://doi.org/10.1038/s41522-026-00957-1
Source : Malaga U.



















