Le café est une boisson appréciée par des millions de personnes à travers le monde. Leur consommation serait également influencée par des facteurs génétiques. Une étude récente menée par une équipe internationale de chercheurs a exploré les liens entre les gènes associés à la consommation de café et les traits ou conditions liés à la santé.
Les chercheurs ont utilisé les données génétiques et les informations sur la consommation de café autodéclarée de 23andMe et de la UK Biobank pour réaliser une étude d’association pangénomique (GWAS).
Comme l’explique le Dr Hayley H. A. Thorpe, auteur principal de l’étude :«Nous avons utilisé ces données pour identifier les régions du génome associées à la probabilité qu’une personne consomme plus ou moins de café. Ensuite, nous avons identifié les gènes et la biologie qui pourraient sous-tendre la consommation de café.»
Le Dr Abraham Palmer, également chercheur principal de l’étude, souligne que la plupart des gens sont surpris d’apprendre qu’il existe une influence génétique sur la consommation de café. Les chercheurs avaient de bonnes raisons de soupçonner, à partir d’études antérieures, qu’il existait des gènes qui influencent la quantité de café qu’une personne consomme.
Des associations génétiques complexes
L’étude a révélé des associations génétiques positives cohérentes entre le café et des résultats de santé néfastes comme l’obésité et la consommation de substances. Cependant, les résultats sont plus complexes en ce qui concerne les troubles psychiatriques.
Comme l’explique le Dr Thorpe, dans l’ensemble de données de 23andMe, la génétique de l’anxiété, du trouble bipolaire et de la dépression tend à être positivement corrélée à la génétique de la consommation de café. En revanche, dans la UK Biobank, on observe le schéma inverse, où ils sont négativement corrélés génétiquement.
Les chercheurs ont également constaté d’autres instances où l’ensemble de données de 23andMe ne correspondait pas à celui de la UK Biobank, mais le plus grand désaccord concernait les troubles psychiatriques.
L’importance du contexte culturel
Les différences de résultats entre les deux ensembles de données peuvent s’expliquer par plusieurs facteurs. Tout d’abord, les enquêtes n’étaient pas identiques. Par exemple, l’enquête de 23andMe demandait la consommation quotidienne de café caféiné en portions de 5 onces (taille d’une tasse), tandis que la UK Biobank demandait le nombre de tasses de café consommées chaque jour, y compris le café décaféiné.
De plus, les enquêtes ne tenaient pas compte des différentes façons de servir le café. Comme le souligne le Dr Thorpe, au Royaume-Uni, le café instantané est généralement préféré, tandis qu’aux États-Unis, le café moulu est plus apprécié. Le Dr Sanchez-Roige mentionne également la tendance américaine à consommer du café chargé d’additifs sucrés, comme les frappuccinos.
Le Dr Palmer ajoute que la GWAS démontre que la relation entre le génotype et le phénotype est plus différente que la relation entre le café et le thé. La génétique influence de nombreux aspects, comme la taille, mais la consommation de café est une décision que les gens prennent, influencée par des normes culturelles qui diffèrent d’un endroit à l’autre.
Comme le souligne le Dr Sanchez-Roige, l’interaction entre le génotype et l’environnement complique l’image. Contrairement à la taille, où le comportement n’a pas beaucoup d’influence, le comportement et les choix effectués dans l’environnement jouent un rôle important dans la consommation de café.
En définitive, cette étude met en lumière la complexité des liens entre la génétique et la consommation de café, ainsi que l’importance de prendre en compte le contexte culturel lors de l’interprétation des résultats. Des recherches supplémentaires seront nécessaires pour mieux comprendre les implications de ces découvertes sur la santé.
Article : « Genome-wide association studies of coffee intake in UK/US participants of European ancestry uncover cohort-specific genetic associations » – DOI: https://www.nature.com/articles/s41386-024-01870-x
